SlowMist a publié une analyse approfondie des risques de sécurité associés aux navigateurs à empreintes digitales. Ces navigateurs maintiennent souvent leurs propres boutiques d'applications ou distribuent des extensions via des serveurs propriétaires, la sécurité dépendant fortement des capacités du fournisseur. Dans l'architecture Electron, le processus principal (environnement Node.js) a un accès complet au système de fichiers pour toutes les données de stockage local dans l'environnement du navigateur. Certains navigateurs à empreintes digitales proposent des fonctionnalités de « synchronisation cloud de l'environnement », qui peuvent télécharger les fichiers Vault des portefeuilles crypto des utilisateurs sur les serveurs cloud du fournisseur si les données des extensions de portefeuille sont incluses dans les sauvegardes.